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martes, 31 de diciembre de 2013

Pneumocystis Pneumonia (Burden) in HIV-infected adults in sub-Saharan Africa: protocol for a systematic review



Carga de la neumonía por Pneumocystis en adultos infectados por el VIH en África subsahariana: protocolo para una revisión sistemática                                
Abstract

Background

Reports from Africa have suggested that pneumocystis pneumonia (PCP) is a less important cause of morbidity than in the developed world. However, more recent studies have shown high seroprevalence rates of 
P. jirovecii in healthy individuals with HIV as well as high rates of clinical disease in African children. This suggests that PCP may be more common in Africa than was previously recognised. Understanding the contribution of PCP to disease in HIV-infected individuals in sub-Saharan Africa (SSA) has important implications for diagnosis, management and resource allocation. We therefore propose to conduct a systematic review and meta-analysis in order to investigate the burden of PCP in this population.
                                         




Methods and design
We plan to search electronic databases and reference lists of relevant articles published from 1995 to May 2013 using broad terms for pneumocystis, HIV/AIDS and sub-Saharan Africa. Studies will be included if they provide clear diagnostic criteria for PCP and well-defined study populations or mortality data (denominator). A novel quality score assessment tool has been developed to ensure fidelity to inclusion criteria, minimise risk of selection bias between reviewers and to assess quality of outcome ascertainment. This will be applied to eligible full-text articles. We will extract data using a standardised form and perform descriptive and quantitative analysis to assess PCP prevalence, mortality and case fatality, as well as the quality of included studies. This review protocol has been published in the PROSPERO International Prospective Register of systematic reviews, registration number CRD42013005530.

Discussion

Our planned review will contribute to the diagnosis and management of community-acquired pneumonia in HIV-infected individuals in SSA by systematically assessing the burden of PCP in this population. We also describe a novel quality assessment tool that may be applied to other prevalence reviews.

Background
Pneumocystis pneumonia (PCP), once the most common opportunistic infection in HIV in developed countries, has declined significantly since the introduction of combination antiretroviral therapy and cotrimoxazole prophylaxis in those regions []. In contrast, early reports from developing countries suggested that PCP was a less important cause of morbidity and mortality, and that other AIDS-associated opportunistic infections such as tuberculosis and enteric pathogens predominate [-]. The apparently low burden of PCP among African adults may be explained by early mortality from other more virulent infections and limited access to sensitive diagnostic tests [,]. This hypothesis is supported by a recent systematic review demonstrating a linear relationship between PCP diagnoses and rising gross domestic product in low- and middle-income countries []. It has also been suggested that environmental and virulence factors may account for the differences in incidence in Africa [].
However, more recent studies have revealed a high seroprevalence of 
P. jirovecii, the cause of PCP, in healthy individuals with HIV [,] as well as high rates of clinical disease in African children [-]. The reported increase in prevalence among adults in the 1990s, possibly as a result of better access to diagnostics and treatment [], may reflect the true epidemiology of PCP, suggesting that this infection may be a more important cause of community-acquired pneumonia in Africa than was previously recognised.
The World Health Organization (WHO) recommends that patients in resource-limited settings start empiric therapy for PCP on the basis of its clinical case definition []. A number of local guidelines have incorporated this into their management protocols. Although this approach may have an acceptable predictive value in the correct clinical and epidemiological context, inaccurate diagnosis carries a number of important implications, especially in resource-poor countries. These include incorrect assessment for intensive care unit eligibility where outcomes with PCP are reportedly poor [] and inappropriate timing of initiation of antiretroviral therapy []. Over-diagnosis also exposes patients unnecessarily to the potentially toxic effects of high dose cotrimoxazole [] and to the morbidity of delaying treatment for other diagnoses such as tuberculosis []. The consequences of under-treating PCP because of a misunderstanding of local prevalence are serious [], with case fatality rates approaching 30% []. A better understanding of the regional prevalence of PCP would therefore support clinical management decisions and may ultimately influence outcomes.
There are a number of published reviews examining the prevalence of HIV-associated PCP in developing countries [,,], but none has focused on the adult population in sub-Saharan Africa (SSA). We therefore, plan to conduct a systematic review and meta-analysis to investigate the burden of PCP among HIV-infected adults in this region, with the hypothesis that PCP has a greater contribution to morbidity and mortality than previously recognised.

Aims and definitions

The primary outcome measures of this systematic review are the prevalence, mortality and case fatality of PCP in HIV-infected adults in SSA. We have defined prevalence as PCP diagnosed among patients with compatible symptoms and signs who would normally warrant testing at a given hospital or clinic. It does not refer to the population prevalence of disease. Mortality is defined as the proportion of deaths in a study cohort that are due to PCP (PCP deaths/total deaths), and case fatality as mortality among confirmed or probable cases (PCP deaths/total PCP diagnoses).
Secondary outcome measures include an assessment of the number and quality of studies addressing the primary research question as well as an analysis of demographic and characteristics of cases. This includes rates of co-infection with tuberculosis and other opportunistic infections. Where possible we also plan to determine the number of participants colonised with  P. jirovecii.

Eligibility criteria

Types of participants

Participants in eligible studies must reside in a SSA country at the time of enrolment and will not be excluded on the basis of legal migration status. We will analyse the data from HIV-1-infected or dual HIV-1-/2-infected adults only. We will include participants from eligible studies with an age cutoff of 15 years.

Study design and setting

We will not limit eligibility on the basis of study design and will include autopsy studies, retrospective and prospective clinical studies. Case reports and review articles will be excluded as will any publication from a paediatric journal. All studies published before 1995 will be excluded. This date cutoff was chosen because it roughly coincides with the introduction of cotrimoxazole prophylaxis in Africa, as well as the development of improved diagnostics for PCP. There will be no restriction on the clinical setting, allowing studies analysing both in- and outpatients at any healthcare level to be included for analysis.

Outcomes

Studies will be included if they provide clear diagnostic criteria and well-defined study populations (denominator) with mortality or case fatality data. Our definition of clinical PCP disease requires any one of the following criteria:
1. A clear clinical case definition (based upon the WHO criteria), including all of the following:
Compatible radiology: bilateral interstitial infiltrates
Compatible clinical presentation: acute/subacute, respiratory distress, hypoxia at rest or desaturation on minimal exertion
Response to PCP therapy after failing empiric antibiotics
No other explanation for presentation
2. Visualisation of oocysts/trophozoites by any method from respiratory specimen
3. Positive PCR (any method) with compatible clinical syndrome responding to PCP therapy
We have defined colonisation with 
P. jirovecii as a positive PCR (any method) on symptomatic patients who have spontaneous recovery without specific PCP therapy.


Methods and design

Search strategy

A broad search strategy has been designed to maximise sensitivity. This has been developed with the assistance of librarians from the Health Sciences Library at the University of Cape Town. The main search comprises individual searches using detailed medical subject heading (MeSH) terms for pneumocystis pneumonia, community-acquired pneumonia and HIV/AIDS combined with terms relevant to SSA. We plan to search Medline (accessed via PubMed), Web of Science (accessed via IST Web of Knowledge), Africa-Wide: NiPAD and CINAHL (both accessed via EBSCO Host) databases in an attempt to identify all relevant articles, irrespective of publication type, listed from 1995. There will be no language restriction. Table 1 shows an outline of our planned search strategy. We will complement this process by reviewing citations of all eligible studies and reviews identified by the search and search in Google Scholar.
Study selection
All studies retrieved by the searches will be imported into Refworks online reference management system (http://www.refworks.com). The first author will screen titles and abstracts for location, patient population and general correlation with our research objectives. Full versions of potentially relevant articles will be obtained to assess eligibility. These will then be independently evaluated for inclusion by two authors. A quality-scoring guide (described below and shown in Table 2) has been developed to allow consistent application of inclusion criteria between authors. Any disagreements on eligibility will be resolved through discussion and consultation with the third author who makes the final decision on selection.

Data extraction
Data will be collected independently by two individual reviewers from each eligible publication and captured onto a standardised form. We plan to extract data from text, tables and figures. Study authors will be contacted in cases of missing data or unclear eligibility criteria. The following variables will be captured:
Study characteristics
○ Year of publication and study period
○ Design, objectives and inclusion criteria
Study population
○ Country and clinical setting
○ Denominator
[filled square] Total recruitment/enrolment and attrition rate
[filled square] Numbers assessed for PCP
○ Characteristics of study participants
[filled square] CD4 count
[filled square] Exposure to antiretroviral therapy and PCP prophylaxis
Diagnostic methods
PCP prevalence
○ Definite PCP estimate with standard error of the estimate
○ Colonisation
Patient characteristics
○ Co-infections with tuberculosis and other opportunistic infections
○ CD4 count, age and gender
○ Exposure to antiretroviral therapy and PCP prophylaxis
PCP deaths
○ Mortality and case fatality
Eligible studies will be categorised according to the outcome data they provide (that is, prevalence, mortality, case fatality) and the clinical setting in which the participants are assessed. These groups are prespecified as inpatients with respiratory symptoms, unselected inpatients and all outpatients.

Quality assessment and risk of bias

A quality assessment tool (Table 2) has been developed and will be applied to screened full-text articles in order to code eligibility decisions and to assess study quality and agreement between investigators. Our scoring system is based on the Newcastle Ottawa Scale and on a novel scale used in a previously published prevalence review []. It scores selection of participants with an emphasis on quality of study design; those with consecutive enrolment and transparency of inclusion criteria achieve the highest scores. A qualitative score of diagnostic methods for PCP is used to assess eligibility and quality of outcome ascertainment. There are also ratings for the quality of denominator and numerator data. Assessment of bias is built into the quality scoring scale. We plan to evaluate risk of selection and attrition bias using the Cochrane guidelines as set out in Review Manager version 5.2 (http://ims.cochrane.org/RevMan). This will inform the feasibility of and selection of studies for a pooled analysis. We also plan to conduct an assessment of the overall strength of evidence obtained from included studies. This will take into account the following factors: allocated quality and risk of bias scores described above; the total number of included studies; and consistency of results across similar clinical settings using the same diagnostic methods. Any disagreements will be resolved by discussion and consensus in consultation with the third author to resolve persistent inconsistencies.

Data synthesis

Prevalence data from individual studies will be combined by random effects meta-analysis according to the Mantel-Haenszel method. Heterogeneity will be evaluated using the χ2-based Q statistic (significant for 
P <0.1) and the I2statistic (>50% to be indicative of ‘notable’ heterogeneity []). STATA software version 9.2 (STATA Corporation, College Station, TX, USA) will be used to perform calculations and the meta-analysis and to produce the forest plots using the metan routine. Should standard errors (SE) not be provided, confidence intervals will be incorporated into the formula, SE = (upper limit - lower limit)/3.92.

Presenting and reporting of results

We plan to make use of flow diagram to summarise the study selection process and detail the reasons for exclusion of studies screened as full text. This will follow the PRISMA guidelines for reporting of systematic reviews []. We will publish our search strategy and quality-scoring tool as supplementary documents. Primary outcome measures will be reported in the prespecified categories described above in the ‘Data extraction’ section. Quantitative data will be presented in evidence tables of individual studies as well as in summary tables and forest plots where appropriate. We plan to report on quality scores and risk of bias for each eligible study. This may be tabulated and accompanied by narrative summaries. A descriptive analysis of the strength of evidence assessment will be reported.



Discussion

To our knowledge there are no published reports of studies that have specifically assessed the burden of PCP in SSA. We plan to address this gap with the systematic review and meta-analysis outlined in this protocol. Furthermore, there are no validated guidelines for the performance of prevalence reviews. We have developed a novel quality scoring system to enhance fidelity to inclusion criteria, reduce selection bias among investigators and to allow for a standardised assessment of the quality of included studies. This system may potentially be adapted for use in future prevalence reviews of other diseases.
The findings of this systematic review will have implications for the clinical management of HIV-associated community-acquired pneumonia in SSA. Understanding the pretest probability of PCP in this setting will help to rationalise treatment decisions and guide interpretation of diagnostic tests. This study may also inform local guidelines and management algorithms in terms of recommendations for empiric therapy and referral for further investigation. Understanding the contribution of PCP to mortality in selected populations is important for resource allocation and motivation for better diagnostic tests. Demonstration of a high case fatality may encourage more aggressive initial management and possibly earlier referral to intensive care units. Our secondary outcome measures will characterise the patients with PCP in this region and may provide a better understanding of rates of co-infection with other opportunistic pathogens. Finally, we hope to identify gaps in research that may form the basis of future studies of various aspects of pneumocystis pneumonia in SSA.

Protocol registration

This review protocol has been published in the PROSPERO International Prospective Register of systematic reviews (http://www.crd.york.ac.uk/PROSPERO), registration number CRD42013005530.


Syst Rev. 2013; 2: 112.
Published online 2013 December 12.doi:  10.1186/2046-4053-2-112
PMCID: PMC3866578


TRADUCTOR GOOGLE (sujeto a correcciones...)

abstracto
P. jirovecii en individuos sanos con el VIH , así como las altas tasas de la enfermedad clínica en niños africanos . Esto sugiere que la PCP puede ser más común en África que se reconocía previamente . La comprensión de la contribución de la PCP a la enfermedad en las personas infectadas por el VIH en el África subsahariana ( SSA) tiene implicaciones importantes para el diagnóstico , la gestión y asignación de recursos . Por tanto, proponemos llevar a cabo una revisión sistemática y meta -análisis con el fin de investigar la carga de la PCP en esta población.
Métodos y diseño
Ir a:

fondo
La neumonía por Pneumocystis (PCP ) , una vez que la infección oportunista más común en el VIH en los países desarrollados , se ha reducido significativamente desde la introducción de la profilaxis con cotrimoxazol y la terapia antirretroviral de combinación en esas regiones [ 1 ] . Por el contrario, los primeros informes de los países en desarrollo sugirieron que la PCP era una causa menos importante de morbilidad y mortalidad , y que otras infecciones oportunistas asociadas con el SIDA , como la tuberculosis y patógenos entéricos predominan [ 2-7 ] . La aparentemente baja carga de la PCP entre los adultos africanos se explica por la mortalidad precoz de otras infecciones más virulentas y el limitado acceso a las pruebas diagnósticas sensibles [8,9] . Esta hipótesis está apoyada por una revisión sistemática reciente que demuestra una relación lineal entre el diagnóstico de PCP y el aumento del producto interno bruto en los países de bajos y medianos ingresos [ 10 ] . También se ha sugerido que los factores ambientales y de virulencia puede dar cuenta de las diferencias en la incidencia en África [ 11 ] .
Sin embargo , estudios más recientes han revelado una alta seroprevalencia de
P. jirovecii , la causa de la PCP , en individuos sanos con VIH [ 12,13 ], así como las altas tasas de la enfermedad clínica en niños africanos [ 14-16 ] . El incremento reportado en la prevalencia entre los adultos en la década de 1990 , posiblemente como resultado de un mejor acceso a los diagnósticos y el tratamiento [ 17 ] , puede reflejar la verdadera epidemiología de la PCP , lo que sugiere que esta infección puede ser una causa más importante de la neumonía adquirida en la comunidad África que fue reconocido previamente .
La Organización Mundial de la Salud (OMS) recomienda que los pacientes en entornos con recursos limitados comienzan la terapia empírica para PCP sobre la base de su definición de caso clínico [ 18 ] . Una serie de guías locales han incorporado esta en sus protocolos de gestión . Aunque este enfoque puede tener un valor predictivo aceptable en el contexto clínico y epidemiológico correcta , diagnóstico inexacto lleva una serie de consecuencias importantes , sobre todo en países de escasos recursos . Estos incluyen la evaluación errónea de la unidad de cuidados intensivos donde los resultados de elegibilidad con PCP se informa pobres [ 19 ] e inapropiado momento del inicio de la terapia antirretroviral [ 20 ] . El sobrediagnóstico también expone a los pacientes innecesariamente a los efectos potencialmente tóxicos de alta cotrimoxazol dosis [ 21 ] y para la morbilidad de retrasar el tratamiento para otros diagnósticos , como la tuberculosis [ 22 ] . Las consecuencias de tratar de menores de PCP debido a un malentendido de prevalencia local son graves [ 11 ] , con tasas de letalidad se aproximan al 30% [ 10 ] . Una mejor comprensión de la prevalencia regional del PCP sería , por tanto, apoyar las decisiones de gestión clínica y, finalmente, puede influir en los resultados .
Hay una serie de comentarios publicados que examinan la prevalencia de PCP asociada al VIH en los países en desarrollo [ 17,22,23 ] , pero ninguno se ha centrado en la población adulta en el África subsahariana ( SSA). Por lo tanto , la intención de llevar a cabo una revisión sistemática y meta -análisis para investigar la carga de la PCP en adultos infectados por el VIH en esta región , con la hipótesis de que la PCP tiene una mayor contribución a la morbilidad y la mortalidad que se reconocía anteriormente .
Objetivos y definiciones
Las medidas de resultado primarias de esta revisión sistemática son la prevalencia , mortalidad y letalidad del PCP en adultos infectados por el VIH en el África subsahariana . Hemos definido la prevalencia como PCP diagnostica entre los pacientes con síntomas compatibles y signos que normalmente justificarían las pruebas en un hospital o clínica dada. No se refiere a la prevalencia poblacional de la enfermedad . La mortalidad se define como la proporción de muertes en un grupo de estudio que se deben a la PCP (muertes PCP / muertes en total), y la letalidad como la mortalidad entre los casos confirmados o probables (muertes PCP / diagnósticos totales PCP) .
Las medidas de resultado secundarias incluyen una evaluación de la cantidad y calidad de los estudios que abordan el problema de investigación primaria, así como un análisis de las características demográficas y de los casos. Esto incluye las tasas de coinfección de tuberculosis y otras infecciones oportunistas. Cuando fue posible, también planeamos para determinar el número de participantes colonizados con P. jirovecii .
Los criterios de elegibilidad
Tipos de participantes

Los participantes en los estudios elegibles deben residir en un país de la SSA en el momento de la matrícula y no serán excluidos sobre la base del estado de la migración legal. Vamos a analizar los datos de sólo adultos HIV-1-/2-infected VIH- 1 - infectados o duales. Vamos a incluir participantes de los estudios elegibles , con un límite de edad de 15 años.
Diseño del estudio y entorno
No vamos a limitar la elegibilidad sobre la base del diseño del estudio y se incluyen estudios de autopsias , estudios clínicos retrospectivos y prospectivos . Los informes de casos y artículos de revisión serán excluidos al igual que cualquier publicación de una revista pediátrica . Se excluyeron todos los estudios publicados antes de 1995. Esta fecha límite fue elegida porque coincide aproximadamente con la introducción de la profilaxis con cotrimoxazol en África , así como el desarrollo de mejores métodos de diagnóstico para la PCP. No habrá restricción en el ámbito clínico , permitiendo estudios que analizan tanto en pacientes ambulatorios y en cualquier nivel de atención médica que se incluirán en el análisis.
Resultados
Los estudios se incluyeron si proporcionan criterios diagnósticos claros y poblaciones de estudio bien definidos ( denominador) con mortalidad o de caso los datos de mortalidad . Nuestra definición de la enfermedad clínica PCP requiere uno cualquiera de los siguientes criterios :
1 . Una clara definición de caso clínico (en base a los criterios de la OMS ), incluyendo todas las características siguientes :
Radiología compatible: infiltrados intersticiales bilaterales
Compatible presentación clínica : aguda / subaguda, dificultad respiratoria , hipoxia en reposo o desaturación de mínimos esfuerzos
La respuesta al tratamiento PCP después de no antibióticos empíricos
No hay otra explicación para su presentación
2 . Visualización de ooquistes / trofozoítos por cualquier método de muestra respiratoria
3 . PCR positiva ( cualquier método ) con el síndrome clínico compatible responder a la terapia de PCP
Hemos definido la colonización con
P. jirovecii como PCR positiva ( cualquier método ) en pacientes sintomáticos que tienen una recuperación espontánea sin tratamiento específico PCP .
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Métodos y diseño
estrategia de búsqueda
Una amplia estrategia de búsqueda ha sido diseñado para maximizar la sensibilidad . Esto ha sido desarrollado con la ayuda de los bibliotecarios de la Biblioteca de Ciencias de la Salud de la Universidad de Ciudad del Cabo. La búsqueda principal consta de búsquedas individuales usando detallada descriptores médicos ( MeSH) para la neumonía por Pneumocystis , la neumonía adquirida en la comunidad y el VIH / SIDA combinados con términos relevantes a la SSA . Tenemos la intención de buscar en Medline ( accede a través de PubMed) , Web of Science ( accede a través de IST Web of Knowledge ) , Africa -Wide : NiPAD y CINAHL (ambos accesibles a través de EBSCO Host) bases de datos en un intento de identificar todos los artículos pertinentes , con independencia de la publicación tipo , que se enumeran a partir de 1995 . No habrá restricción de idioma . La Tabla 1 muestra un esquema de la estrategia de búsqueda planificada . Vamos a complementar este proceso mediante la revisión de las citas de todos los estudios elegibles y revisiones identificados por la búsqueda y la búsqueda en Google Scholar.
Tabla 1
Tabla 1
estrategia de búsqueda
selección de los estudios
Todos los estudios recuperados por las búsquedas se importarán a Refworks sistema de gestión de referencia en línea ( http://www.refworks.com ) . El primer autor se proyectará los títulos y resúmenes de ubicación, población de pacientes y correlación general con nuestros objetivos de investigación. Se obtuvieron las versiones completas de los artículos potencialmente relevantes para evaluar la elegibilidad . Estos serán luego evaluados de forma independiente para su inclusión por dos autores. Una guía de calidad de puntuación (que se describe a continuación y se muestran en la Tabla 2 ) se ha desarrollado para permitir una aplicación coherente de los criterios de inclusión entre los autores. Los desacuerdos sobre la elegibilidad se resolvieron mediante discusión y consulta con un tercer autor que toma la decisión final sobre la selección .
Tabla 2
Tabla 2
Herramienta de evaluación de calidad
extracción de los datos
Los datos serán recogidos de forma independiente por dos revisores individuales de cada publicación elegible y capturados en un formulario estandarizado. Tenemos la intención de extraer datos de texto, tablas y figuras. Se contactó con los autores en los casos de datos faltantes o criterios de elegibilidad poco claras . Se capturarán las siguientes variables:
características del estudio
○ Fecha de publicación y el período de estudio
○ Diseño , objetivos y criterios de inclusión
población de estudio
○ País y contexto clínico
○ Denominador
[ plaza llena ] reclutamiento Total / matrícula y tasa de deserción
[ plaza llena ] Números evaluados para PCP
○ Características de los participantes en el estudio
[ plaza llena ] recuento de CD4
[ plaza llena ] La exposición a la terapia antirretroviral y la profilaxis de PCP
Los métodos de diagnóstico
prevalencia PCP
○ estimación PCP definido con el error estándar de la estimación
○ La colonización
características de los pacientes
○ Las coinfecciones con tuberculosis y otras infecciones oportunistas
○ recuento de CD4 , la edad y el género
○ La exposición a la terapia antirretroviral y la profilaxis de PCP
muertes PCP
○ La mortalidad y la letalidad
Los estudios elegibles se clasifican de acuerdo a los datos de los resultados que ofrecen (es decir, prevalencia, mortalidad , letalidad ) y el contexto clínico en el que se evalúan los participantes. Estos grupos se especificó previamente como pacientes con síntomas respiratorios, los pacientes hospitalizados no seleccionados y todos los pacientes ambulatorios .
Evaluación de la calidad y el riesgo de sesgo
Una herramienta de evaluación de la calidad (Tabla 2 ) se ha desarrollado y se aplicará a cribado artículos de texto completo con el fin de codificar las decisiones de elegibilidad y para evaluar la calidad del estudio y el acuerdo entre los investigadores. Nuestro sistema de puntuación se basa en la Newcastle Ottawa escala y en una novela escala utilizada en una revisión prevalencia publicado previamente [ 24 ] . Récords Es la selección de los participantes con un énfasis en la calidad del diseño del estudio , los que tienen reclutamiento consecutivo y transparencia de los criterios de inclusión lograr las calificaciones más altas . Una puntuación cualitativa de los métodos de diagnóstico de PCP se utiliza para evaluar la elegibilidad y la calidad de la evaluación de resultados . También hay valoraciones sobre la calidad de los datos del denominador y del numerador . Evaluación del sesgo está integrada en la escala de puntuación de calidad. Tenemos la intención de evaluar el riesgo de selección y sesgo de desgaste mediante las guías Cochrane según lo establecido en el Review Manager versión 5.2 ( http://ims.cochrane.org/RevMan ) . Esto informará a la viabilidad y selección de los estudios para un análisis agrupado. También tenemos planes para llevar a cabo una evaluación de la fortaleza general de los resultados obtenidos en los estudios incluidos . Esto tomará en cuenta los siguientes factores : calidad asignado y riesgo de las puntuaciones de polarización descritos anteriormente , el número total de estudios incluidos , y de consistencia de los resultados entre los entornos clínicos similares usando los mismos métodos de diagnóstico. Los desacuerdos se resolvieron mediante discusión y consenso en consulta con el tercer revisor para resolver las incoherencias persistentes.
síntesis de los datos
Los datos de prevalencia de los estudios individuales se combinarán mediante efectos aleatorios meta- análisis de acuerdo con el método de Mantel- Haenszel . La heterogeneidad se evaluó mediante la estadística Q basado en χ2 (significativo para
P < 0,1 ) y el I2statistic ( > 50 % para ser indicativo de la heterogeneidad ' notable ' [ 25 ] ) . Software STATA versión 9.2 (Stata Corporation, College Station, TX, EE.UU. ) se utiliza para realizar los cálculos y el meta- análisis y para producir los diagramas de bosque mediante la rutina metan . En caso de errores estándar ( SE ) ​​no se proporcionarán , los intervalos de confianza serán incorporados a la fórmula, SE = (límite superior - límite inferior ) / 3,92 .
La presentación y notificación de los resultados
Tenemos la intención de hacer uso del diagrama de flujo para resumir el proceso de selección de los estudios y detalle los motivos de la exclusión de los estudios seleccionados como texto completo. Esto seguirá las directrices de presentación de informes PRISMA de las revisiones sistemáticas [26]. Vamos a publicar nuestra estrategia de búsqueda y una herramienta de calidad de puntuación , como documentos complementarios . Se informaron las medidas de resultado primarias en las categorías especificadas previamente descritos anteriormente en la sección " Extracción de los datos ' . Los datos cuantitativos se presentan en tablas de evidencia de los estudios individuales , así como en cuadros sinópticos y diagramas de bosque en su caso . Tenemos la intención de informar acerca de sus niveles de calidad y el riesgo de sesgo de cada estudio elegible. Esto puede ser tabulada y acompañada de resúmenes narrativos. Se informó un análisis descriptivo de la fuerza de la valoración de la prueba .
Ir a:

discusión
Hasta donde sabemos , no hay informes publicados de los estudios que han evaluado específicamente la carga de la PCP en el África subsahariana . Tenemos la intención de llenar este vacío con la revisión sistemática y meta -análisis se describe en este protocolo. Por otra parte, no existen pautas validadas para la realización de revisiones de prevalencia. Hemos desarrollado un sistema de calificación de la calidad novedosa para mejorar la fidelidad a los criterios de inclusión , reducir el sesgo de selección entre los investigadores y para permitir una evaluación estandarizada de la calidad de los estudios incluidos. Este sistema puede potencialmente ser adaptado para su uso en futuras revisiones de prevalencia de otras enfermedades.
Los resultados de esta revisión sistemática tendrán implicaciones para el manejo clínico de la neumonía adquirida en la comunidad asociada con el VIH en el África subsahariana . La comprensión de la probabilidad pretest de PCP en este entorno le ayudará a racionalizar las decisiones de tratamiento y la interpretación de la guía de pruebas de diagnóstico . Este estudio también puede informar a las directrices locales y algoritmos de gestión en cuanto a las recomendaciones para el tratamiento empírico y referencia para una mayor investigación. La comprensión de la contribución de la PCP a la mortalidad en poblaciones seleccionadas es importante para la asignación de recursos y la motivación para obtener mejores pruebas de diagnóstico. Demostración de una alta tasa de letalidad puede alentar el tratamiento inicial más agresivo y posiblemente antes derivación a las unidades de cuidados intensivos. Las medidas de resultado secundarias caracterizarán los pacientes con PCP en esta región y pueden proporcionar una mejor comprensión de las tasas de co -infección con otros patógenos oportunistas. Por último , esperamos identificar las lagunas en la investigación que puede servir de base para futuros estudios sobre diversos aspectos de la neumonía por Pneumocystis en el África subsahariana .
registro de Protocolo
Este protocolo de la revisión ha sido publicada en el Registro prospectivo PROSPERO Internacional de las revisiones sistemáticas ( http://www.crd.york.ac.uk/PROSPERO ) , número de registro CRD42013005530


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